CLEAN工具成功安装经历——蛋白酶精准预测工具

发布时间:2026/7/21 16:47:42

CLEAN工具成功安装经历——蛋白酶精准预测工具
!!!!重要!!!! 所有工作开始前,请注意原文作者给的重要提示: CLEAN是2023年发表在Science主刊上的一篇文章介绍的工具,其对酶蛋白的分类预测(功能预测)为目前行业精准度最高。根据对不同工具的比较,不同工具间的精准度在30-60%之间,而CLEAN做到了86.75~100%;1)对原作提供的安装方案添加了部分注释,方便新人理解;2)提供了一个成功安装实例——适合零基础的新手参考安装;从零基础开始,要安装单机版CLEAN蛋白酶功能预测工具,需要预先Linux版系统,如Ubuntu;Windows10及以上的系统,还可以使用Windows版的linux子系统(代码版),即WSL;在使用CLEAN等一般生信平台软件时,与Linux系统并无差别。win10pro、win11pro可很方便的安装WSL;但如果你用的CMGE版win10,则全过程需要纯手工,需要花费一些力气;有了wsl,就可以参考原作提供的安装方案,或是分割线后面的安装实例,自行安装尝试;如果你课题支持充裕,那么花钱买方便,无疑能够节省巨量宝贵时间; 既然不是屌丝,为什么要花费大量时间去搞这些?下面提供一个真实安装实例(最终是安装成功了的):既然有了原作者提供的安装步骤,接下来,打开了网页版的readme.md文件(也可下载后打开),根据提示,cd到CLEAN文件夹:cd CLEAN/app/ 如果没有提前创建这个路径,创建;再运行上面的命令; CLEAN的路径一般是建立在 \Ubuntu\home\current_user\ 下面;mkdir CLEAN cd ~/CLEAN/ mkdir app # 1,创建CLEAN路径;2,进入CLEAN路径;3,在CLEAN路径下创建新的子路径 app;之后是创建一个名称为clean的环境,pathon版本为3.10.4conda create -n clean python==3.10.4 -y

相关新闻

rafx渲染线程池设计:提升多线程渲染性能的最佳实践

rafx渲染线程池设计:提升多线程渲染性能的最佳实践

2026/7/21 16:47:42

rafx渲染线程池设计:提升多线程渲染性能的最佳实践 【免费下载链接】rafx Multi-backend renderer with asset pipeline. The objective of this repo is to build a scalable, flexible, data driven renderer. 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/ra/raf…

算法复杂度分析实战:Google Interview University中的Big-O notation详解

算法复杂度分析实战:Google Interview University中的Big-O notation详解

2026/7/21 16:47:42

算法复杂度分析实战:Google Interview University中的Big-O notation详解 【免费下载链接】google-interview-university A complete daily plan for studying to become a Google software engineer. 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/googl/google-int…

libsm64调试技巧:使用调试打印功能追踪游戏逻辑

libsm64调试技巧:使用调试打印功能追踪游戏逻辑

2026/7/21 16:37:42

libsm64调试技巧:使用调试打印功能追踪游戏逻辑 【免费下载链接】libsm64 Mario 64 as a library for use in external game engines 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/li/libsm64 libsm64是一个将《超级马里奥64》游戏引擎封装为库的开源项目&…

终极指南:如何参与昇腾原生openPangu-Embedded-7B开源生态建设

终极指南:如何参与昇腾原生openPangu-Embedded-7B开源生态建设

2026/7/21 21:58:00

终极指南:如何参与昇腾原生openPangu-Embedded-7B开源生态建设 【免费下载链接】openPangu-Embedded-7B-model 昇腾原生的开源盘古 Embedded-7B 语言模型 项目地址: https://ai.gitcode.com/ascend-tribe/openpangu-embedded-7b-model 在人工智能技术快速发展…

RTX5060双版本解析:架构差异与能效优化

RTX5060双版本解析:架构差异与能效优化

2026/7/21 21:58:00

1. RTX5060双版本架构解析:2026年甜品卡的进化之路作为NVIDIA 50系显卡的中坚力量,RTX5060延续了"60"系列的甜品定位,但首次采用桌面与移动端同步开发的策略。从芯片层面来看,两个版本均基于AD106-225-KX核心的改良版&a…

Buzz离线语音转文字终极指南:如何在本地电脑上安全高效地处理音频文件

Buzz离线语音转文字终极指南:如何在本地电脑上安全高效地处理音频文件

2026/7/21 21:58:00

Buzz离线语音转文字终极指南:如何在本地电脑上安全高效地处理音频文件 【免费下载链接】buzz Buzz transcribes and translates audio offline on your personal computer. Powered by OpenAIs Whisper. 项目地址: https://gitcode.com/GitHub_Trending/buz/buzz …

让游戏机变身全能B站客户端:wiliwili带你解锁跨平台追番新姿势!

让游戏机变身全能B站客户端:wiliwili带你解锁跨平台追番新姿势!

2026/7/21 21:58:00

让游戏机变身全能B站客户端:wiliwili带你解锁跨平台追番新姿势! 【免费下载链接】wiliwili 第三方B站客户端,目前可以运行在PC全平台、PSVita、PS4 、Xbox 和 Nintendo Switch上 项目地址: https://gitcode.com/GitHub_Trending/wi/wiliwil…

B站自动化管理神器:BiliBiliToolPro 让账号管理轻松无忧

B站自动化管理神器:BiliBiliToolPro 让账号管理轻松无忧

2026/7/21 21:58:00

B站自动化管理神器:BiliBiliToolPro 让账号管理轻松无忧 【免费下载链接】BiliBiliToolPro B 站(bilibili)自动任务工具,支持docker、青龙、k8s等多种部署方式。全面拥抱AI。敏感肌也能用。 项目地址: https://gitcode.com/GitH…

AI辅助重构老Android项目:从Eclipse到现代架构的升级实践

AI辅助重构老Android项目:从Eclipse到现代架构的升级实践

2026/7/21 21:48:00

1. 项目背景与技术选型 七年前的老Android项目往往面临技术栈陈旧、架构过时、依赖库失效等典型问题。我接手的这个项目最初采用Eclipse开发,基于Android 4.4 API级别,使用早已废弃的ActionBarSherlock和Apache HttpClient等组件。代码中充斥着AsyncTask…

微服务进阶:服务网格与Istio

微服务进阶:服务网格与Istio

2026/7/21 5:45:57

541|微服务进阶:服务网格与Istio 上篇文章我们聊了微服务的基本概念和拆分方法。 但微服务多了,问题也多了: 服务之间怎么通信? 怎么监控每个服务的调用链路? 熔断、限流、重试怎么做? 安全认证怎么统一? 以前这些都靠SDK库(比如Hystrix、Feign),每个服务都要集成…

零售超级终端全域协同:ShareKit 碰一碰商品流转业务落地案例

零售超级终端全域协同:ShareKit 碰一碰商品流转业务落地案例

2026/7/21 9:56:14

一、零售门店全域协同业务背景与行业痛点 1.1 门店超级终端设备矩阵(连锁便利店/商超标准配置) 自助收银Kiosk一体机:顾客结算、自助核销优惠券、商品素材预览;运营折叠平板:店长后台商品上新、图片录入、活动配置、…

噗叽短视频界面分析

噗叽短视频界面分析

2026/7/21 3:09:32

1 和小红书类似,可以采用类似判断方法------------其实他比小红书好判断,因为他没有图片,控件位置几乎是固定的,都不用判断------------2 因为他没有点赞按钮------------而且几乎所有控件位置都是完全一样的,所以我就…

GraphRAG Local + Ollama:微软知识图谱本地化

GraphRAG Local + Ollama:微软知识图谱本地化

2026/7/21 0:06:35

普通 RAG 有个老毛病:你问它「这堆文档整体在讲什么」,它答不上来。因为它只会把问题切成向量,去几十个文本块里捞最相似的几段拼给模型看。可「整体讲什么」这种问题,答案根本不在任何单独一段里——它散在全篇的联系里。 微软的…

AI 数据产品化思考:让分析能力变成可售卖的数据服务

AI 数据产品化思考:让分析能力变成可售卖的数据服务

2026/7/21 0:06:35

AI 数据产品化思考:让分析能力变成可售卖的数据服务 大家好,我是朱大喜。这周一直在复盘具体的项目和技术,最后一篇聊点不一样的东西——数据产品化。做了这么多年数据分析,我发现一个规律:能卖出去的从来不是"分…

基于人机协作的 AI 研发新体系架构:从 Harness 工程到 Loop 工程实践

基于人机协作的 AI 研发新体系架构:从 Harness 工程到 Loop 工程实践

2026/7/21 0:06:35

本文完整呈现了企业级 AI Coding 落地的核心方法论:从 Harness 工程的微观/宏观定义,到 Loop 工程的六大构建模块,再到基于 SDD(规范驱动开发)的工程化落地路径。干货较多,建议收藏细读。 我从 22 年开始就…